支付宝注册时提示“您输入的手机号码已经被注册”，是因为该手机号码之前已经注册过支付宝账户。

解决方法：一个手机号码只能注册一个支付宝账户，若出现此提示，该手机号码已经无法再次注册，可以继续使用该手机号码注册的支付宝账户。