iTunes 7 目前可以读取、写入以及转换於 MP3、AIFF、WAV、MPEG-4、AAC 与 Apple Lossless 之间。

iTunes 也能播放任何 QuickTime 能播放的 (甚至是一些视频格式)，包括来自 iTunes Store 与 Audible. com 有声书的 受保护的 AAC 档案。为了播放其他格式，例如内含 Ogg 的 Vorbis 或 Speex 编码，iTunes 需要安装 Xiph QuickTime 元件。iTunes 目前不能正确地播放 HE-AAC/aacPlus 音频串流。HE-AAC/aacPlus 格式档案能播放成 22 kHz AAC 档案 (实际上其没有超过 11 kHz 高音界线)。HE-AAC 串流音频 (一些 Internet Radio 频道所使用) 完全无法播放。

iTunes 的 Windows 版本能自动地转换未受保护的 WMA (包括版本 9) 档案至其他的音频格式，但它不支持直接播放或编译过的 WMA 格式。