荣耀6至尊版相对于普通版来讲主要在硬件配置方面有较大的升级，其CPU为由麒麟920升级为麒麟928，后者将四个A15处理器主频升级到2.0GHz，而另外四个1.3GHz的A7处理器保持不变，采用了28nm HPM工艺制作，同时配有协处理器坚持传感器数据，GPU为Mali T628MP4。手机的RAM为3GB 800MHz双通道LPDDR3内存，而ROM由普通版的16GB升级为32GB，最高支持128GB的Micro SD卡扩展。